位点特异性的蛋白质光交联探针已经成为研究活细胞内蛋白质-蛋白质相互作用的关键工具。陈鹏课题组长期致力于发展基于遗传密码子拓展的蛋白质光交联技术。在之前的工作中,他们设计了高效光敏感非天然氨基酸交联探针(DiZPK),能够广泛地用于捕捉活细胞内的蛋白-蛋白相互作用(Nat. Chem. Biol., 2011, 7, 671-677; J. Am. Chem. Soc., 2011, 133, 20581-20587.)。
最近,在上述工作的基础之上,该课题组发展了“可切割”的新一代光交联探针DiZSeK(下图)。与原有探针相比,新一代探针在高效捕捉蛋白相互作用的同时,其骨架中所含的硒原子能够在过氧化氢氧化条件下断裂,从而实现对光交联获得的“诱饵蛋白-靶标蛋白”复合物的分离。课题组进一步改进了能够与靶标蛋白上产生的次硒酸基团发生特异反应的捕获试剂,实现了对靶标蛋白的特异标记和富集。上述新技术,使课题组在后续二维凝胶电泳实验中有效去除了诱饵蛋白的干扰,完成了对特定蛋白的全细胞靶标蛋白质谱分析与鉴定。新一代“可切割型”光交联探针的开发,将有力地推动基于蛋白质光交联技术的蛋白质组学研究。该工作近日在美国化学会志上发表(Lin SX, et al, J. Am. Chem. Soc. 2014, DOI10.1021/ja504371w), 并被美国化学会的官方杂志Chemical & Engineering News以News of the Week的形式进行了报道。 陈鹏实验室的研究生林世贤是该文第一作者,同时化学与分子工程学院何丹、张帅、生命科学联合中心龙腾和凤凰平台质谱中心孟荣老师为论文的发表做出了重要贡献。此项研究得到了国家自然科学基金委、科技部和北大-清华生命科学联合中心的资助。
DiZSeK